培训时间:2016年6月3日-5日 培训地点:北京化工大学(东校区)
主办单位:格致斯创迅奇(北京)科技有限公司
目前使用LAMMPS做分子动力学模拟的老师和同学越来越多了,由于LAMMPS源代码本身的复杂性,很多人入门学习需要花费很多时间,大大浪费时间和精力,由格致斯创迅奇(北京)科技有限公司举办的分子动力学模拟LAMMPS培训(初级班)能够为广大LAMMPS爱好者提供一个短期内可以完成LAMMPS入门并学习基本使用操作的好机会,提供您详实的培训教程,解决您遇到的使用问题,通过我们之前举办的LAMMPS培训班的学员反馈以及经验总结,我们会为您提供更加实用的培训内容以及详细的现场操作练习。
鉴于培训班质量考虑,本次LAMMPS培训学员限额36人,报满为止。
1. 根据往届LAMMPS培训班经验,要求本次学员提前熟悉Linux环境基本操作。(重点是文件相关基本操作)
请提前下载安装以下软件:
- ♦VMD和OVITO
以下是下载链接:http://www.ks.uiuc.edu/Development/Download/download.cgi?PackageName=VMD
http://ovito.org/index.php/download
- ♦SSH可执行程序windows版,请下载并安装:http://ultra.pr.erau.edu/~jaffem/classes/SSHSecureShellClient-3.2.9.exe
2. 请学员自带笔记本电脑
►培训班联系人:
刘经理 手机:13522434960 座机:010-67506231
邮箱:liuhuanhuan@gainstrong.net 网址:www.gainstrong.net
►培训班报名:
请编辑信息:单位+姓名+职称+邮箱+电话 发送邮件到 info@gainstrong.net
►主讲人介绍(按培训先后顺序):
1. 刘老师,清华大学博士,北京化工大学副教授。2008-2009年赴加州大学伯克利分校与Berend Smit教授合作研究。主要研究兴趣是应用量子化学和分子模拟等手段在微观层次上重新认识化学工程中的重要问题。目前研究方向主要有离子液体的结构-性质 关系,新型捕集二氧化碳溶剂的分子设计,生物质预处理过程的机理探讨等。在J. Phys. Chem. B, PCCP等主流期刊发表论文20余篇,总引用近千次。
2. 王老师,理学博士,有较为丰富的lammps使用经验,运用 lammps所做的科研工作已经发表在ACS Macro letters, Carbon, Scientific Reports, Computational Materials Science等国际学术期刊。
►培训课程:
6月3日
8:00-9:00
学员签到,领取资料
9:00-11:30
作为科学研究手段的分子模拟:历史与展望
分子模拟的优势和局限
分子模拟的基本框架:建模(前处理)/采样(模拟)/分析(后处理)
11:30-13:30
午餐,午休
13:30-17:00
分子动力学模拟基本原理:运动方程/边界/截断/长程作用/系综...
模拟数据分析基础:热力学性质/时间相关函数/微观结构/自由能
分子间作用势(力场)简介和参数优化
Linux基础
lammps编译
openpbs任务提交系统
6月4日
LAMMPS上机实战1
8:30-11:30
用 LAMMPS操作完成Lennard-Jones melt, crack 两个问题的分子动力学模拟,并将结果利用VMD、OVITO软件进行可视化。
学员在此阶段可以学习LAMMPS in文件的编写及可视化软件VMD,OVITO的使用,制作精美图片、动画。
通过几个练习,学员亲自上机实践,加深对lammps关键命令的理解。
11:30-13:30
午餐,午休
LAMMPS上机实战2
13:30-17:00
学习data文件的结构以及编写方法和注意事项, 学习用VMD、Moltemplate、MS软件来建立涉及水、碳管、石墨烯、高分子链等的初始构型,并导出lammps能用的data文件的方法。
通过具体的练习,亲自操作,加深学员对于这些软件、方法的掌握。用生成的碳管data文件,运行lammps完成碳管拉伸断裂模拟实验。
6月5日
LAMMPS上机实战3
8:30-11:30
利用LAMMPS完成melt, crack以及碳管拉断问题的研究,并分析模拟所得结果。
运用lammps对系统施加不同载荷、控温、控压等操作的实现;如何在lammps模拟中输出后续分析所需要的系统不同层次的信息;
进一步讲解VMD、OVITO在模拟结果分析中的作用。
通过具体的练习来加深学员对lammps施加不同载荷的命令的理解。
11:30-13:30
午餐,午休
LAMMPS上机实战4
13:30-17:00
全原子分子动力学模拟、粗粒化分子动力学模拟实例讲解。
通过多个实例的演示学习,加强学员对lammps模拟中主要文件的编写、系统平衡、时间步长选择、出错调试等等一系列重要问题的认识。
答疑解惑,互动讨论。
►培训费用(包括资料费、培训费、午餐费,不含差旅及住宿费)
培训费用 |
1人参加 |
同一单位≥2人,可享受优惠 |
老师 |
2300元 |
2000元 |
学生 |
1800元 |
1500元 |
►汇款账号:
户名:格致斯创迅奇(北京)科技有限公司
账号:693438855
开户银行:中国民生银行股份有限公司北京广安门支行
►培训地址:北京市朝阳区北三环东路15号北京化工大学(东校区)