SIESTA材料模拟基础班-网络在线培训--格致斯创(北京)科技有限公司

SIESTA材料模拟基础班-网络在线培训日期：2020-01-14 11:06:12 阅读：次

培训时间：2020年1月10日 19:00整 准时上线

培训方式 ：在线网络培训（共4次，每次讲课时间一小时，答疑时间不计）

一次学不会，可免费参加第二次学习

感兴趣的学员可以添加QQ：171298164 加入SIESTA学习讨论群共同学习！

格致斯创公司已成功举办多次现场培训课程，受到各位老师和同学们的广泛关注。格致斯创公司将于新年伊始开展首次网络在线培训，面向更多感兴趣的学员提供教学，欢迎各位老师同学们报名参加！

SIESTA是一个免费开源软件，可用于分子和固体的电子结构计算和分子动力学模拟。它使用标准的Kohn-Sham自恰密度泛函方法，支持局域密度近似(LDA-LSD)或广义梯度近似(GGA)泛函方法。由于采用数值原子轨道的线性组合(LCAO)的基组，使得计算时间和内存可以随原子数线性标度，相对于付费的VASP软件，SIESTA可以在一般的工作站上模拟更大的体系。

所有参加培训的学员都可以进行跟随讲师自行上机操作练习，由国家超级计算深圳中心为学员提供充足稳定的测试资源。国家超级计算深圳中心采用曙光6000超级计算系统，每个计算节点由2颗Intel X5650六核心处理器组成、主频2.66GHz，内存48 GB Mem，NV Fermi C2050 GPGPU，QDR IB网络，曙光ParaStor或Lustre并行文件系统。整体计算能力实测峰值为1.271千万亿次浮点运算(1.271PFLOPS)。

►主讲老师

汪老师：理学博士，研究方向为二维材料的电子结构性质模拟。科研工作中主要开展第一性原理模拟计算单层黑磷，石墨烯，蓝磷等的电子结构性质。精通熟练应用SIESTA、 VASP、 Nwchem、 QuantumEspresso 等材料模拟软件，擅长高通量计算和机器学习相关软件（pymatgen，ase等）。长期从事软件编译、技术培训、科研工作，有非常丰富的软件培训教学经验。

►课程大纲
(1). 密度泛函理论(DFT)及相关软件介绍；
(2). Linux，MS 基础以及 Linux 系统软件安装；
(3). siesta 基本原理及其赝势和基组；
(4). siesta 常见计算参数设置；
(5). siesta 实例详细介绍；
(6). 课堂讨论及答疑。

siesta 课程主题	siesta 课程内容
一、密度泛函理论(DFT)及相关软件介绍	1.DFT 密度泛函理论基本原理方法 2.Hohenberg-Kohn 定理 3.Kohn-Sham 方程 4.DFT理论在材料模拟中的应用
二、 Linux， MS 基础以及 Linux 系统软件安装	1. Linux 基本操作：文件复制，移动，重命名，比较，任务提交，删除 2．Material Studio 结构模型创建 3．常见软件在 Linux下的编译和安装 4. 常见任务管理系统介绍，以及队列系统中任务的提交管理
三、 siesta 基本原理及其赝势和基组	1．siesta 程序介绍，安装及简单例子运行测试 2. siesta 赝势设置 3. siesta 基组设置 4. siesta 输入文件 fdf 设置 5. siesta 实际例子（Si 晶体和 H2O 分子）计算
四、 siesta 常见计算参数设置	1.结构优化、能量和性质计算流程；输入和输出文件内容的讲解；关键词的使用方法；断点重启、计算结构可视化。 2.泛函的选择、自旋极化设置、 K-points 设置、布里渊区路径设置、并行运行方法、基组的选择、轨道截断半径设置等 3.重要参数的原理、设置技巧、使用注意事项；常见问题的处理方法；关键字的设置和应用方法；高精度计算的案例操作。
五、高级建模以及 siesta应用实例	1. 纳米量子点结构模拟分析（Si 纳米团簇，单分子计算） 2. 一维纳米条带,纳米线结构搭建；缺陷、掺杂体系分析等（armchair 和 zigzag 纳米管以及 stone-wall 缺陷） 3. 二维纳米平面结构，石墨烯计算 4. 材料晶格动力学分析计算（Si 动力学稳定） 5. 基于第一性原理分子动力学计算判断材料稳定性（晶体 MD 分析） 6. 材料力学性能计算（体相材料弹性常数和断裂分析） 7. 磁性材料计算模拟（氢化石墨烯条带磁性分析） 8.三维体相能带结构及其态密度分布计算（晶体 band 和 dos 计算） 9. 光学性质计算（平面氮化硼和立方氮化硼的对比分析） 10.表面模型搭建，表面吸附模型等（二维石材料吸附计算） 11. 高通量计算，机器学习和pymatgen软件简介
六、课堂互动及答疑	1.分组讨论 2.专题技术讨论 3.课后技术指导 4.综合计算练习