HTMD/ACEMD 软件更新 HTMD/ACEMD 软件更新 日期:2019-02-27 标签: 阅读: 简介:在应用于药物设计方面,HTMD针对分子动力学具有独特的Python环境,从系统的初始构建到分析(分子)复杂的(运动)轨迹。我们提出了好几个“在线运行协议”,它们可以在线运行(应用)。

  

HTMD针对PlayMolumer的协议环境已经可行

 

在应用于药物设计方面,HTMD针对分子动力学具有独特的Python环境,从系统的初始构建到分析(分子)复杂的(运动)轨迹。我们提出了好几个“在线运行协议”,它们可以在线运行(应用)例如:蛋白的制备(残片的质子化)、系统的构建(溶剂、嵌入蛋白膜)和参数化(针对分子力场的参数化)。

 

 

 

 蛋白的制备(残片的质子化)

系统的构建(溶剂、嵌入蛋白膜)

参数化(针对分子力场的参数化)

 

 


 

 

 

 

 

 

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